gruodžio 22, 2015
VUL Santariškių klinikos
Vėžio žymenų tyrimams – inovacija, įkvėpta gamtos

Šiuolaikinis vėžio gydymas kelia naujus reikalavimus audinių patologijos tyrimų tikslumui, atkartojamumui bei gaunamos informacijos išsamumui. Molekulinių biožymenų tyrimai vėžio audiniuose vis dažniau pasitelkiami parenkant taikininę terapiją bei numatant tolimesnę ligos eigą,  tačiau jų erdvinis pasiskirstymas vėžio audinyje gali būti netolygus (heterogeniškas). Todėl pasirinkta vėžio terapija gali būti veiksminga vienai vėžio ląstelių populiacijai ir  visiškai netinkama kitoms, nulemiančiomis tolesnį ligos progresavimą.

Vėžio audinio heterogeniškumo ir integruotų biožymenų nustatymo problemą sprendė tarptautinė tyrėjų komanda, vadovaujama prof. Arvydo Laurinavičiaus. Vilniaus universiteto, Kanų universiteto (Caen, Prancūzija) ir Notingemo universiteto (Nottingham, JK) tyrėjai (Indra Baltrušaitytė, Justinas Besusparis, Ian Ellis, Yasir Iqbal, Paulette Herlin, Aida Laurinavičienė, Raimundas Meškauskas, Benoit Plancoulaine ir kiti)  įgyvendino ES Socialinio fondo projektą „Išsamus biožymenų raiškos intranavikinio heterogeniškumo įvertinimas skaitmeninės imunohistochemijos vaizdo analizės būdu“.

Pasinaudodami naujomis galimybėmis, kurias teikia skaitmeninės patologijos technologijos, tyrėjai sukūrė unikalias vėžio audinio heterogeniškumo vertinimo metodologijas. Erdvinių biožymenų raiškos aspektų vertinimui pritaikytas šešiakampės gardelės (medaus korio) principas, matematiškai apdorojant mikroskopinio vaizdo analizės rezultatus ir generuojant išsamų biožymens raiškos rodiklių rinkinį. Tokiu būdu, be įprastinio biožymens vidutinės raiškos audinyje nustatymo, galima apskaičiuoti erdvinės entropijos, bimodališkumo ir kt. rodiklius, automatiškai ir standartizuotai nustatyti „karštus“ taškus bei įvertinti jų dydį ir „temperatūrą“ (pasiūlyta  „Pareto karštojo taško“ koncepcija), aptikti ir eliminuoti vaizdo analizės artefaktus, atskleisti ir kiekybiškai įvertinti integruotus biožymenis – vidinius veiksnius, valdančius susietą daugybinių IHC žymenų variaciją tiriamajame audinyje.

Projekto metu taip pat buvo atlikti analitinio ir klinikinio validavimo eksperimentai, kurie leido nustatyti naujus nepriklausomus prognostinius krūties vėžio parametrus (integruotas Ki67/SATB1 žymuo, Ki67 raiškos bimodalinis pobūdis). Išsamiosios IHC koncepcija, kaip visuotinio IHC testo (C. R. Taylor, 2000) plėtinys skaitmeninių technologijų eroje, apibendrinta kviestiniame straipsnyje (Comprehensive immunohistochemistry: digital, analytical, integrated.  Pathobiology, 2015, spaudoje).

„Sukurtos metodologijos ir analizės įrankiai iš esmės yra universalūs. Jie gali būti pritaikomi įvairiems biožymenims įvairiuose audiniuose vertinti, taip pat gali būti integruojami su įvairiais mikroskopinio vaizdo analizės įrankiais. Sukaupėme unikalią patirtį mikroskopinio vaizdo analitikos srityje ir matome plačias plėtros ir taikymo perspektyvas. Projekte naudojomės Santaros slėnio Skaitmeninės ir molekulinės patologijos laboratorijos technologijų platforma, savo ruožtu, projekto dėka sukūrėme gerą pagrindą jos moksliniam konkurencingumui ir tolesnei plėtrai“, – komentavo prof. Arvydas Laurinavičius. „Galima sakyti, matematinė medaus korio konstrukcija yra įkvėpta gamtos, tačiau iš tiesų ji gana seniai ir sėkmingai taikoma geografijos, ekologijos ir kituose moksluose, pažengusiuose erdvinio modeliavimo srityje. Mums tiesiog kilo mintis šį principą pritaikyti mikroskopiniams vėžio vaizdams, dabar atrodo savaime suprantama…“.

Projektas „Išsamus biožymenų raiškos intranavikinio heterogeniškumo įvertinimas skaitmeninės imunohistochemijos vaizdo analizės būdu“ (NR.VP1-3.1-ŠMM-07-K-03-051) buvo vykdomas 2013-05-02 – 2015.11.30) ir finansuojamas Europos Sąjungos Socialinio fondo lėšomis, įgyvendinant priemonę „Parama mokslininkų ir kitų tyrėjų mokslinei veiklai (visuotinė dotacija)“.

Share Button


rugsėjo 18, 2020

Sveikatos apsaugos ministerija (SAM) informuoja, kad nuo šiol viešojo maitinimo įstaigose – restoranuose, kavinėse, baruose bei kitose maistą tiekiančiose įstaigose, […]

rugsėjo 17, 2020

Nacionalinis visuomenės sveikatos centras (NVSC) informuoja, kad per praėjusią parą Lietuvoje patvirtinti 62 koronavirusinės infekcijos (COVID-19) atvejai. 22 iš jų […]

rugsėjo 17, 2020

Nacionalinio visuomenės sveikatos centro (NVSC) specialistų ir mokyklų, darželių bendruomenių bendradarbiavimas yra pagrindinis raktas į sėkmę, siekiant ugdymo įstaigose užtikrinti […]

rugsėjo 16, 2020

​Artėjant terminui, kai turėtų baigtis Europos Sąjungos (ES) ir Jungtinės Karalystės (JK) suderėtas pereinamasis laikotarpis – 2020 m. gruodžio 31 […]

rugsėjo 16, 2020

Karštos politikų diskusijos dėl valstybinių vaistinių įteisinimo tik atitraukia dėmesį nuo chaoso kompensuojamųjų vaistų tvarkos sistemoje ir kitų nesprendžiamų pacientams […]

rugsėjo 15, 2020

Mažesniuose miestuose įsikūrusios vaistinės ir jų darbuotojai 2021-ųjų laukia su nerimu – vaistinės gali būti priverstos užsidaryti, pacientai – likti […]

rugsėjo 15, 2020

Pasklidus informacijai apie tai, kad kai kurios gydymo įstaigos reikalauja gimdymo metu dėvėti kaukes, Sveikatos apsaugos ministerija (SAM) informuoja, kad […]

rugsėjo 13, 2020

Šiuo metu koronaviruso sukelta liga COVID-19 iš viso serga 12 Jurbarko rajono gyventojų. Vienas sergantis asmuo gydomas ligoninėje, visi kiti […]

rugsėjo 13, 2020

  Nacionalinis visuomenės sveikatos centras (NVSC) praneša, kad Vilniaus Gabijos progimnazijoje šiandien ryte nustatyti 6 koronavirusinės infekcijos atvejai mokiniams. Tik […]

rugsėjo 9, 2020

Rugsėjo 9 d. vėžiu sergančių vaikų paramos fondas „Mamų unija“ jaukiame bičiulių ir rėmėjų rate atvėrė naujų, dar dažais kvepiančių […]

rugsėjo 9, 2020

Nuo šiol asmenys, kurie turėjo sąlytį su sergančiais koronavirusine infekcija (COVID-19), arba lankėsi susirgusiųjų nurodytose buvimo vietose, savo duomenis Nacionalinio […]

rugsėjo 7, 2020

Sveikatos apsaugos ministerija (SAM) praneša, kad šią savaitę, nuo rugsėjo 7 d. iki rugsėjo 13 d. imtinai, Molėtų, Kauno, Trakų, […]

rugsėjo 4, 2020

Keturiose įmonėse pastaruoju metu fiksuoti 11 koronaviruso (COVID-19) atvejų nuo šiol bus vertinami kaip vienas židinys. Toks sprendimas priimtas, atsižvelgus, […]

rugsėjo 3, 2020

Nacionalinio visuomenės sveikatos centro (NVSC) specialistai, gavę informacijos, kad vienoje Raseinių rajono mokykloje izoliavosi kelios mokinių klasės, informuoja, kad šioje […]

rugsėjo 2, 2020

Pastebėjus viešojoje erdvėje plintančią klaidinančią informaciją dėl vaikų, pajutusių galimus koronaviruso (COVID-19) simptomus, priverstinio izoliavimo nesuderinus su tėvais, Sveikatos apsaugos […]

rugsėjo 2, 2020

Įmonių, įstaigų, organizacijų socialinė atsakomybė stiprėja, o supratimas, jog nuo visų priklauso, kokią situaciją dėl koronaviruso (COVID-19) turėsime Lietuvoje, auga […]

rugpjūčio 31, 2020

Prasidedant mokslo metams Sveikatos apsaugos ministerija (SAM) skelbia rekomendacijas, kaip saugiai valdyti mokinių srautus organizuojant maitinimą pradinio, pagrindinio ir vidurinio […]

rugpjūčio 31, 2020

Sveikatos apsaugos ministerija (SAM) praneša, kad šią savaitę, nuo rugpjūčio 31 d. iki rugsėjo 6 d. imtinai, Molėtų, Kauno, Trakų, […]

rugpjūčio 31, 2020

Nacionalinis visuomenės sveikatos centras (NVSC) informuoja, kad per praėjusią parą Lietuvoje patvirtinti 32 koronavirusinės infekcijos (COVID-19) atvejai. 16 iš jų […]

rugpjūčio 29, 2020

Mokytojai ir kiti švietimo įstaigų darbuotojai, jei to pageidaus, jau artimiausiomis dienomis galės išsitirti dėl koronaviruso (COVID-19) infekcijos. Jiems bus […]