gruodžio 22, 2015
VUL Santariškių klinikos
Vėžio žymenų tyrimams – inovacija, įkvėpta gamtos

Šiuolaikinis vėžio gydymas kelia naujus reikalavimus audinių patologijos tyrimų tikslumui, atkartojamumui bei gaunamos informacijos išsamumui. Molekulinių biožymenų tyrimai vėžio audiniuose vis dažniau pasitelkiami parenkant taikininę terapiją bei numatant tolimesnę ligos eigą,  tačiau jų erdvinis pasiskirstymas vėžio audinyje gali būti netolygus (heterogeniškas). Todėl pasirinkta vėžio terapija gali būti veiksminga vienai vėžio ląstelių populiacijai ir  visiškai netinkama kitoms, nulemiančiomis tolesnį ligos progresavimą.

Vėžio audinio heterogeniškumo ir integruotų biožymenų nustatymo problemą sprendė tarptautinė tyrėjų komanda, vadovaujama prof. Arvydo Laurinavičiaus. Vilniaus universiteto, Kanų universiteto (Caen, Prancūzija) ir Notingemo universiteto (Nottingham, JK) tyrėjai (Indra Baltrušaitytė, Justinas Besusparis, Ian Ellis, Yasir Iqbal, Paulette Herlin, Aida Laurinavičienė, Raimundas Meškauskas, Benoit Plancoulaine ir kiti)  įgyvendino ES Socialinio fondo projektą „Išsamus biožymenų raiškos intranavikinio heterogeniškumo įvertinimas skaitmeninės imunohistochemijos vaizdo analizės būdu“.

Pasinaudodami naujomis galimybėmis, kurias teikia skaitmeninės patologijos technologijos, tyrėjai sukūrė unikalias vėžio audinio heterogeniškumo vertinimo metodologijas. Erdvinių biožymenų raiškos aspektų vertinimui pritaikytas šešiakampės gardelės (medaus korio) principas, matematiškai apdorojant mikroskopinio vaizdo analizės rezultatus ir generuojant išsamų biožymens raiškos rodiklių rinkinį. Tokiu būdu, be įprastinio biožymens vidutinės raiškos audinyje nustatymo, galima apskaičiuoti erdvinės entropijos, bimodališkumo ir kt. rodiklius, automatiškai ir standartizuotai nustatyti „karštus“ taškus bei įvertinti jų dydį ir „temperatūrą“ (pasiūlyta  „Pareto karštojo taško“ koncepcija), aptikti ir eliminuoti vaizdo analizės artefaktus, atskleisti ir kiekybiškai įvertinti integruotus biožymenis – vidinius veiksnius, valdančius susietą daugybinių IHC žymenų variaciją tiriamajame audinyje.

Projekto metu taip pat buvo atlikti analitinio ir klinikinio validavimo eksperimentai, kurie leido nustatyti naujus nepriklausomus prognostinius krūties vėžio parametrus (integruotas Ki67/SATB1 žymuo, Ki67 raiškos bimodalinis pobūdis). Išsamiosios IHC koncepcija, kaip visuotinio IHC testo (C. R. Taylor, 2000) plėtinys skaitmeninių technologijų eroje, apibendrinta kviestiniame straipsnyje (Comprehensive immunohistochemistry: digital, analytical, integrated.  Pathobiology, 2015, spaudoje).

„Sukurtos metodologijos ir analizės įrankiai iš esmės yra universalūs. Jie gali būti pritaikomi įvairiems biožymenims įvairiuose audiniuose vertinti, taip pat gali būti integruojami su įvairiais mikroskopinio vaizdo analizės įrankiais. Sukaupėme unikalią patirtį mikroskopinio vaizdo analitikos srityje ir matome plačias plėtros ir taikymo perspektyvas. Projekte naudojomės Santaros slėnio Skaitmeninės ir molekulinės patologijos laboratorijos technologijų platforma, savo ruožtu, projekto dėka sukūrėme gerą pagrindą jos moksliniam konkurencingumui ir tolesnei plėtrai“, – komentavo prof. Arvydas Laurinavičius. „Galima sakyti, matematinė medaus korio konstrukcija yra įkvėpta gamtos, tačiau iš tiesų ji gana seniai ir sėkmingai taikoma geografijos, ekologijos ir kituose moksluose, pažengusiuose erdvinio modeliavimo srityje. Mums tiesiog kilo mintis šį principą pritaikyti mikroskopiniams vėžio vaizdams, dabar atrodo savaime suprantama…“.

Projektas „Išsamus biožymenų raiškos intranavikinio heterogeniškumo įvertinimas skaitmeninės imunohistochemijos vaizdo analizės būdu“ (NR.VP1-3.1-ŠMM-07-K-03-051) buvo vykdomas 2013-05-02 – 2015.11.30) ir finansuojamas Europos Sąjungos Socialinio fondo lėšomis, įgyvendinant priemonę „Parama mokslininkų ir kitų tyrėjų mokslinei veiklai (visuotinė dotacija)“.

Share Button


vasario 13, 2020

Vasario 11 dieną rajono Biržų rajono savivaldybės mero pavaduotoja Astra Korsakienė apsilankė „Vyturėlio“ vaikų darželyje. Svarbiausias šios viešnagės tikslas buvo […]

vasario 5, 2020

Valstybinė ligonių kasa (VLK) daugiau nei milijonui šalies gyventojų per „Sodros“ asmenines paskyras www.sodra.lt/gyventojui išsiuntė kvietimus pasitikrinti, kiek per metus kainavo iš […]

vasario 3, 2020

Jungtinei Karalystei (JK) pasitraukus iš Europos Sąjungos (ES), daugeliui toje šalyje gyvenančių mūsų tautiečių, kaip ir Lietuvoje likusių jų artimųjų, […]

sausio 31, 2020

Nors Lietuvoje šiuo metu nei įtariamų, nei patvirtintų naujojo koronaviruso infekcijos atvejų nenustatyta, Sveikatos apsaugos ministerijos (SAM) Ekstremalių situacijų operacijų […]

sausio 27, 2020

Pirmadienį Sveikatos apsaugos ministerijoje (SAM) surengtame SAM Ekstremaliųjų situacijų operacijų centro posėdyje aptarta naujausia situacija dėl Kinijoje plintančio koronaviruso, esami […]

sausio 24, 2020

Žmonių gyvenimas, kuriems prireikia vienokio ar kitokio organo transplantacijos, tiesiogiai priklauso nuo visuomenės pritarimo organų donorystei. Per 20 metų pritarimą […]

sausio 21, 2020

Nors laisvai pasirinkti gydymo įstaigą, kurioje norima gauti pirminės asmens sveikatos priežiūros bei šeimos gydytojo paslaugas, privalomuoju sveikatos draudimu apdrausti […]

sausio 14, 2020

Seimas šiandien priėmė Sveikatos apsaugos ministerijos (SAM) parengtas įstatymų pataisas, kuriomis reglamentuota, kas laikoma alternatyviąja ir papildomąja medicina, nustatyti tokioms […]

sausio 13, 2020

Nuo Naujųjų metų įsigaliojo „žalos be kaltės“ modelis, užtikrinsiantis, kad pacientai galės greičiau ir paprasčiau gauti kompensaciją, jei jų sveikatai […]

sausio 9, 2020

Patrikas Poškaitis (16 m.) gyvena Kėdainiuose. Pirmą kartą Lietuvos sveikuolių sąjungoje atsidūrė 13 m., kai tėtis jį užregistravo į vaikų […]