22 gruodžio, 2015
VUL Santariškių klinikos

Vėžio žymenų tyrimams – inovacija, įkvėpta gamtos

Šiuolaikinis vėžio gydymas kelia naujus reikalavimus audinių patologijos tyrimų tikslumui, atkartojamumui bei gaunamos informacijos išsamumui. Molekulinių biožymenų tyrimai vėžio audiniuose vis dažniau pasitelkiami parenkant taikininę terapiją bei numatant tolimesnę ligos eigą,  tačiau jų erdvinis pasiskirstymas vėžio audinyje gali būti netolygus (heterogeniškas). Todėl pasirinkta vėžio terapija gali būti veiksminga vienai vėžio ląstelių populiacijai ir  visiškai netinkama kitoms, nulemiančiomis tolesnį ligos progresavimą.

Vėžio audinio heterogeniškumo ir integruotų biožymenų nustatymo problemą sprendė tarptautinė tyrėjų komanda, vadovaujama prof. Arvydo Laurinavičiaus. Vilniaus universiteto, Kanų universiteto (Caen, Prancūzija) ir Notingemo universiteto (Nottingham, JK) tyrėjai (Indra Baltrušaitytė, Justinas Besusparis, Ian Ellis, Yasir Iqbal, Paulette Herlin, Aida Laurinavičienė, Raimundas Meškauskas, Benoit Plancoulaine ir kiti)  įgyvendino ES Socialinio fondo projektą „Išsamus biožymenų raiškos intranavikinio heterogeniškumo įvertinimas skaitmeninės imunohistochemijos vaizdo analizės būdu“.

Pasinaudodami naujomis galimybėmis, kurias teikia skaitmeninės patologijos technologijos, tyrėjai sukūrė unikalias vėžio audinio heterogeniškumo vertinimo metodologijas. Erdvinių biožymenų raiškos aspektų vertinimui pritaikytas šešiakampės gardelės (medaus korio) principas, matematiškai apdorojant mikroskopinio vaizdo analizės rezultatus ir generuojant išsamų biožymens raiškos rodiklių rinkinį. Tokiu būdu, be įprastinio biožymens vidutinės raiškos audinyje nustatymo, galima apskaičiuoti erdvinės entropijos, bimodališkumo ir kt. rodiklius, automatiškai ir standartizuotai nustatyti „karštus“ taškus bei įvertinti jų dydį ir „temperatūrą“ (pasiūlyta  „Pareto karštojo taško“ koncepcija), aptikti ir eliminuoti vaizdo analizės artefaktus, atskleisti ir kiekybiškai įvertinti integruotus biožymenis – vidinius veiksnius, valdančius susietą daugybinių IHC žymenų variaciją tiriamajame audinyje.

Projekto metu taip pat buvo atlikti analitinio ir klinikinio validavimo eksperimentai, kurie leido nustatyti naujus nepriklausomus prognostinius krūties vėžio parametrus (integruotas Ki67/SATB1 žymuo, Ki67 raiškos bimodalinis pobūdis). Išsamiosios IHC koncepcija, kaip visuotinio IHC testo (C. R. Taylor, 2000) plėtinys skaitmeninių technologijų eroje, apibendrinta kviestiniame straipsnyje (Comprehensive immunohistochemistry: digital, analytical, integrated.  Pathobiology, 2015, spaudoje).

„Sukurtos metodologijos ir analizės įrankiai iš esmės yra universalūs. Jie gali būti pritaikomi įvairiems biožymenims įvairiuose audiniuose vertinti, taip pat gali būti integruojami su įvairiais mikroskopinio vaizdo analizės įrankiais. Sukaupėme unikalią patirtį mikroskopinio vaizdo analitikos srityje ir matome plačias plėtros ir taikymo perspektyvas. Projekte naudojomės Santaros slėnio Skaitmeninės ir molekulinės patologijos laboratorijos technologijų platforma, savo ruožtu, projekto dėka sukūrėme gerą pagrindą jos moksliniam konkurencingumui ir tolesnei plėtrai“, – komentavo prof. Arvydas Laurinavičius. „Galima sakyti, matematinė medaus korio konstrukcija yra įkvėpta gamtos, tačiau iš tiesų ji gana seniai ir sėkmingai taikoma geografijos, ekologijos ir kituose moksluose, pažengusiuose erdvinio modeliavimo srityje. Mums tiesiog kilo mintis šį principą pritaikyti mikroskopiniams vėžio vaizdams, dabar atrodo savaime suprantama…“.

Projektas „Išsamus biožymenų raiškos intranavikinio heterogeniškumo įvertinimas skaitmeninės imunohistochemijos vaizdo analizės būdu“ (NR.VP1-3.1-ŠMM-07-K-03-051) buvo vykdomas 2013-05-02 – 2015.11.30) ir finansuojamas Europos Sąjungos Socialinio fondo lėšomis, įgyvendinant priemonę „Parama mokslininkų ir kitų tyrėjų mokslinei veiklai (visuotinė dotacija)“.


Nuotr. kitzcorner, shutterstock
26 birželio, 2025

Kelionės – puikus būdas pažinti pasaulį, atitrūkti nuo rutinos ir patirti naujų įspūdžių. Tačiau su džiaugsmu neretai ateina ir tam […]

19 birželio, 2025

Raukšlių atsiradimas – natūralus procesas, žymintis odos senėjimą, aplinkos poveikį bei gyvenimo būdo ypatumus. Nors tai neišvengiama, daugelis žmonių ieško […]

11 birželio, 2025

Šiuolaikiniame pasaulyje sveikatos priežiūra evoliucionuoja nuo siaurų specializacijų link visapusiško, holistinio požiūrio į žmogaus organizmo funkcionavimą. Lietuvoje šis pokytis taip […]

4 birželio, 2025

Kėdainių rajono savivaldybės merui Valentinui Tamuliui nepratęsus patalpų nuomos sutarties su Greitosios medicinos pagalbos tarnyba (GMPT), kėdainiškiai gali rajone likti […]

27 balandžio, 2025

Kasdien eidami per laukus ar žvilgtelėję į daržų pakraščius, dažnai nė nesusimąstome, kad po kojomis mindome tikrus gamtos lobius. Kiaulpienė, […]

27 balandžio, 2025

Įsibėgėjus pavasariui, ir augalams pradėjus barstyti žiedadulkes, Higienos instituto Sveikatos stiprinimo centro specialistai parengė rekomendacijas alergiškiems žmonėms, kaip sumažinti žiedadulkių […]

23 balandžio, 2025

Sveikatos apsaugos ministerija teikia įstatymų pakeitimus, kuriais siekia pagerinti sveikatos paslaugų prieinamumą, suteikiant galimybę medikams teikti nuotolines paslaugas dirbant už […]

13 balandžio, 2025

Vykdant sveikatos apsaugos sistemos reformą sveikatos centrų pagrindu, Garliavoje duris atvėrė iš esmės atsinaujinęs Garliavos medicinos centro ir LSMU Kauno […]

9 balandžio, 2025

Mokslo pažangai tobulėjant, daugelis žmonių griebiasi papildų, siekdami skatinti sveiką senėjimą ir prailginti gyvenimo trukmę. Tarp žadančiųjų junginių ilgaamžiškumo srityje […]

31 kovo, 2025

Praradus dantis ar susidūrus su jų pažeidimais, kokybiškas protezavimas tampa ne tik estetikos, bet ir sveikatos bei gyvenimo kokybės klausimu. […]

25 kovo, 2025

Sveiki, stiprūs ir greitai augantys plaukai – daugelio moterų (ir ne tik)  siekiamybė. Tačiau norint pasiekti šį tikslą, būtina derinti […]

25 kovo, 2025

Pastaraisiais metais maisto pramonėje labai išpopuliarėjo tokie terminai kaip „ekologiškas“ ir „tvarus“. Dažnai šie terminai naudojami kaip sinonimai. Nors auginant […]

12 kovo, 2025

Vokietijos žvalgybos agentūra BND surinko patikimų įrodymų, kad koronaviruso pandemija prasidėjo dėl nuotėkio iš laboratorijos Kinijos Vuhano mieste, teigiama trijuose […]

5 kovo, 2025

Prienų globos namuose įvyko pirmąjį kartą bendrosios praktikos slaugytojams (visų specializacijų), slaugytojų padėjėjams, socialiniams darbuotojams, individualios priežiūros darbuotojams, kineziterapeutams, ergoterapeutams, […]

4 kovo, 2025

Klaipėdoje bus įkurti nauji globos namai senyvo amžiaus asmenims. Kaip pranešė savivaldybė, socialinės infrastruktūros objektą numatyta įkurti Melnragėje.  Skelbiama, kad […]

2 kovo, 2025

Premjero Gintauto Palucko vadovaujama Vyriausybė savo kadencijos metu sieks susigrąžinti iš Lietuvos išvykusius bei šiuo metu neaktyvius sveikatos priežiūros specialistus, […]

28 vasario, 2025

Nacionalinis visuomenės sveikatos centras (NVSC) praneša, kad 2023 metų pavasarį per klaida buvo nutenkinti 2021 ir 2022 m. infekcinėmis ligomis […]

25 vasario, 2025

Ar pastebėjote, kaip juodasis šokoladas ar puodelis kakavos gali pagerinti nuotaiką net po sunkios dienos? Šiame straipsnyje aptarsime, kaip antioksidantai, […]

20 vasario, 2025

Jau artimiausiu metu Europos Komisija turėtų pateikti svarstymui Ypatingos svarbos vaistų aktą (Critical Medicines Act). Jo poreikis kilo susidūrus su […]

14 vasario, 2025

Penktadienį Kaune oficialiai atidarytas naujas Lietuvos sveikatos mokslų universiteto (LSMU) Kauno ligoninės padalinys – Ortopedijos traumatologijos klinika. Anot Kauno ligoninės, naujosios […]

Regionų naujienos