22 gruodžio, 2015
VUL Santariškių klinikos

Vėžio žymenų tyrimams – inovacija, įkvėpta gamtos

Šiuolaikinis vėžio gydymas kelia naujus reikalavimus audinių patologijos tyrimų tikslumui, atkartojamumui bei gaunamos informacijos išsamumui. Molekulinių biožymenų tyrimai vėžio audiniuose vis dažniau pasitelkiami parenkant taikininę terapiją bei numatant tolimesnę ligos eigą,  tačiau jų erdvinis pasiskirstymas vėžio audinyje gali būti netolygus (heterogeniškas). Todėl pasirinkta vėžio terapija gali būti veiksminga vienai vėžio ląstelių populiacijai ir  visiškai netinkama kitoms, nulemiančiomis tolesnį ligos progresavimą.

Vėžio audinio heterogeniškumo ir integruotų biožymenų nustatymo problemą sprendė tarptautinė tyrėjų komanda, vadovaujama prof. Arvydo Laurinavičiaus. Vilniaus universiteto, Kanų universiteto (Caen, Prancūzija) ir Notingemo universiteto (Nottingham, JK) tyrėjai (Indra Baltrušaitytė, Justinas Besusparis, Ian Ellis, Yasir Iqbal, Paulette Herlin, Aida Laurinavičienė, Raimundas Meškauskas, Benoit Plancoulaine ir kiti)  įgyvendino ES Socialinio fondo projektą „Išsamus biožymenų raiškos intranavikinio heterogeniškumo įvertinimas skaitmeninės imunohistochemijos vaizdo analizės būdu“.

Pasinaudodami naujomis galimybėmis, kurias teikia skaitmeninės patologijos technologijos, tyrėjai sukūrė unikalias vėžio audinio heterogeniškumo vertinimo metodologijas. Erdvinių biožymenų raiškos aspektų vertinimui pritaikytas šešiakampės gardelės (medaus korio) principas, matematiškai apdorojant mikroskopinio vaizdo analizės rezultatus ir generuojant išsamų biožymens raiškos rodiklių rinkinį. Tokiu būdu, be įprastinio biožymens vidutinės raiškos audinyje nustatymo, galima apskaičiuoti erdvinės entropijos, bimodališkumo ir kt. rodiklius, automatiškai ir standartizuotai nustatyti „karštus“ taškus bei įvertinti jų dydį ir „temperatūrą“ (pasiūlyta  „Pareto karštojo taško“ koncepcija), aptikti ir eliminuoti vaizdo analizės artefaktus, atskleisti ir kiekybiškai įvertinti integruotus biožymenis – vidinius veiksnius, valdančius susietą daugybinių IHC žymenų variaciją tiriamajame audinyje.

Projekto metu taip pat buvo atlikti analitinio ir klinikinio validavimo eksperimentai, kurie leido nustatyti naujus nepriklausomus prognostinius krūties vėžio parametrus (integruotas Ki67/SATB1 žymuo, Ki67 raiškos bimodalinis pobūdis). Išsamiosios IHC koncepcija, kaip visuotinio IHC testo (C. R. Taylor, 2000) plėtinys skaitmeninių technologijų eroje, apibendrinta kviestiniame straipsnyje (Comprehensive immunohistochemistry: digital, analytical, integrated.  Pathobiology, 2015, spaudoje).

„Sukurtos metodologijos ir analizės įrankiai iš esmės yra universalūs. Jie gali būti pritaikomi įvairiems biožymenims įvairiuose audiniuose vertinti, taip pat gali būti integruojami su įvairiais mikroskopinio vaizdo analizės įrankiais. Sukaupėme unikalią patirtį mikroskopinio vaizdo analitikos srityje ir matome plačias plėtros ir taikymo perspektyvas. Projekte naudojomės Santaros slėnio Skaitmeninės ir molekulinės patologijos laboratorijos technologijų platforma, savo ruožtu, projekto dėka sukūrėme gerą pagrindą jos moksliniam konkurencingumui ir tolesnei plėtrai“, – komentavo prof. Arvydas Laurinavičius. „Galima sakyti, matematinė medaus korio konstrukcija yra įkvėpta gamtos, tačiau iš tiesų ji gana seniai ir sėkmingai taikoma geografijos, ekologijos ir kituose moksluose, pažengusiuose erdvinio modeliavimo srityje. Mums tiesiog kilo mintis šį principą pritaikyti mikroskopiniams vėžio vaizdams, dabar atrodo savaime suprantama…“.

Projektas „Išsamus biožymenų raiškos intranavikinio heterogeniškumo įvertinimas skaitmeninės imunohistochemijos vaizdo analizės būdu“ (NR.VP1-3.1-ŠMM-07-K-03-051) buvo vykdomas 2013-05-02 – 2015.11.30) ir finansuojamas Europos Sąjungos Socialinio fondo lėšomis, įgyvendinant priemonę „Parama mokslininkų ir kitų tyrėjų mokslinei veiklai (visuotinė dotacija)“.


2 gruodžio, 2020

Siekdama skatinti racionalų psichotropinių vaistinių preparatų skyrimą ir vartojimą bei išvengti neteisėto psichotropinių vaistinių preparatų įsigijimo klastojant popierinių receptų blankus, […]

Prezidentūros nuotr.
2 gruodžio, 2020

Lietuvos Respublikos Prezidentas Gitanas Nausėda antradienį mišriu nuotoliniu būdu susitiko su Sveikatos ekspertų taryba, kuri pristatė naujausias rekomendacijas dėl epidemiologinės […]

Autizmas - ne kliūtis lankytis bibliotekoje / Organizatorių nuotr
1 gruodžio, 2020

Nuo lapkričio mėnesio Lietuvos viešųjų bibliotekų duris puošia spalvota dėlionė „Biblioteka visiems“. Tai ženklas, kad biblioteka nuo šiol tampa atviresnė […]

1 gruodžio, 2020

Siekdama sumažinti rizikos grupės asmenų, sergančių koronavirusu (COVID-19) srautus į šalies gydymo įstaigų priėmimo skyrius ir Greitosios medicinos pagalbos stotis […]

30 lapkričio, 2020

Vilniaus miesto savivaldybė papildė sąrašą asmenų grupių, galinčių nemokamai išsitirti greitaisiais testais, parodančiais, ar žmogus yra turėjęs sąlytį su SARSCoV-2, […]

30 lapkričio, 2020

Visame pasaulyje vis dažniau taikoma praktika, kai keleiviai COVID-19 testą gali atlikti tiek oro uosto patalpose, tiek aplink esančioje teritorijoje […]

27 lapkričio, 2020

Europos ligų prevencijos ir kontrolės centro (ECDC) duomenimis, Lietuva ir toliau stabiliai rūpinasi gyventojų testavimu dėl koronaviruso (COVID-19). Lapkričio 26 […]

27 lapkričio, 2020

Praėjus dviem savaitėms nuo papildomo Covid-19 skambučių centro darbo pradžios, prie šalies verslų įkurtos socialinės iniciatyvos „Įveiksime kartu“ jungiasi ne tik […]

27 lapkričio, 2020

Stropiai besimokantis, bet nesuprantantis ironijos ir neskiriantis blogio nuo gėrio. Būtent tokie dirbtiniam intelektui priskiriami bruožai suteikia argumentų skeptikams, o […]

27 lapkričio, 2020

Reaguodama į epidemiologinę situaciją šalyje, didėjantį izoliuojamų gyventojų skaičių ir mokslininkų išvadas bei rekomendacijas, Sveikatos apsaugos ministerija (SAM) atnaujino izoliacijos […]

25 lapkričio, 2020

Tomas prisimena, kad pirmieji ligos simptomai pasireiškė vairuojant automobilį. „Gerai, kad staiga ištikęs priepuolis buvo trumpas ir mašiną pavyko suvaldyti. […]

25 lapkričio, 2020

Radviliškio rajono pirminės sveikatos priežiūros centre spalio mėnesį pradėjo dirbti nauja gydytoja Inga Giedrienė. Gydytoja yra baigusi Lietuvos sveikatos mokslų […]

25 lapkričio, 2020

Nacionalinis visuomenės sveikatos centras (NVSC) informuoja, kad per praėjusią parą Lietuvoje patvirtinti 2289 koronavirusinės infekcijos (COVID-19) atvejai. 606 iš jų […]

25 lapkričio, 2020

Gamintojams ruošiantis išleisti į rinką vakciną nuo koronaviruso (COVID-19), Sveiktos apsaugos ministerija (SAM) parengė gyventojų vakcinacijos priemonių planą. Pirmą šio […]

24 lapkričio, 2020

VšĮ Radviliškio rajono pirminės sveikatos priežiūros centre nuo šių metų spalio mėnesio dirba jaunas ir perspektyvus šeimos gydytojas Vytautas Brazauskas. […]

23 lapkričio, 2020

Nacionalinis visuomenės sveikatos centras (NVSC) informuoja, kad per praėjusią parą Lietuvoje patvirtinti 1192 koronavirusinės infekcijos (COVID-19) atvejai. 364 iš jų […]

23 lapkričio, 2020

poliLietuvos Respublikos Prezidentas Gitanas Nausėda, pirmadienį mišriu nuotoliniu būdu susitikęs su Sveikatos ekspertų tarybos nariais, aptarė atnaujintas COVID-19 pandemijos plėtros […]

23 lapkričio, 2020

Pacientams po organų transplantacijos atstovaujanti Lietuvos asociacija „Gyvastis“ dar nuo šių metų kovo mėnesio skambino pavojaus varpais dėl ženkliai išaugusių […]

23 lapkričio, 2020

Pasaulyje ir Lietuvoje siaučiant COVID-19 pandemijai, į papildomas fronto linijas kartu su medikais stojančių vaistininkų ima kritiškai trūkti. Lietuvos vaistinių […]

20 lapkričio, 2020

Nacionalinis visuomenės sveikatos centras (NVSC) informuoja, kad per praėjusią parą Lietuvoje patvirtinti 2272 koronavirusinės infekcijos (COVID-19) atvejai. 670 iš jų […]